El Gabinete de Dibujo y Artes Gráficas está ubicado en la Sala Federalismo y Centralismo del segundo piso; su objetivo es exhibir de manera periódica piezas pertenecientes a la colección de dibujo y obra gráfica del Museo Nacional de Colombia, que en la actualidad está conformada por 437 acuarelas, dibujos y grabados como litografías, aguafuertes y aguatintas, entre otros.
La exposición del gabinete es rotada tres veces al año con el objetivo de garantizar unas condiciones adecuadas para la conservación -control de la iluminación, humedad y temperatura- de la obra sobre papel, ya que ésta no puede permanecer expuesta a la luz por más de cuatro meses consecutivos.